PLP wirkt als Coenzym bei allen Transaminationsreaktionen und bei bestimmten Decarboxylierungs-, Deaminierungs- und Razemisierungs-Reaktionen von Aminosäuren.die Aldehydgruppe von PLP bildet eine Schiff-Base-Verknüpfung (internes Aldimin) mit der ε-Aminogruppe einer spezifischen Lysin-Gruppe des Aminotransferase-Enzyms. Die α-Aminogruppe des Aminosäuresubstrat verdrängt die ε-Aminogruppe der aktiven Stelle
Lysinrückstand in einem Prozess, der als Transaldimination bekannt ist. Das resultierende externe Aldimin kann ein Proton, Kohlendioxid oder eine Aminosäure Sidechain verlieren, um ein Quinoid-Zwischenprodukt zu werden, das wiederum als Nucleophil in mehreren Reaktionswegen wirken kann. Bei der Transamination akzeptiert das Quinoid-Zwischenprodukt nach der Deprotonation ein Proton an einer anderen Position, um ein Ketimin zu werden. Das resultierende Ketimin wird hydrolysiert, so dass die Aminogruppe auf dem Komplex bleibt.
Darüber hinaus wird PLP von Aminotransferasen (oder Transaminasen) verwendet, die auf ungewöhnliche Zucker wie Perosamin und Desosamin wirken.
In diesen Reaktionen reagiert das PLP mit Glutamat, das seine Alpha-Aminogruppe zu PLP überträgt, um Pyridoxaminphosphat (PMP) zu bilden. PMP überträgt dann seinen Stickstoff auf den Zucker, so dass ein Amino-Zucker.
PLP ist auch an verschiedenen Beta-Eliminationsreaktionen beteiligt, wie den Reaktionen durch Serindehydratase und GDP-4-Keto-6-Deoxymannose-3-Dehydratase (kalt).
Es ist auch in der Kondensationsreaktion in der Hämsynthese aktiv.
PLP spielt eine Rolle bei der Umwandlung von Levodopa in , erleichtert die Umwandlung des exzitatorischen Neurotransmitters Glutamat in den hemmenden Neurotransmitter GABA, und ermöglicht SAM zu decarboxylieren, um Propylamin, das ein Vorläufer von Polyaminen ist, zu bilden.
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